不同的水產消毒劑的失效時間與使用劑量、成分等有很密切的關系，消毒劑的使用注意閱讀產品使用說明。

而以EM、光合細菌等等為代表的自養性細菌是以異養性細菌氨氮、硫化氫等等代謝物為生的一類細菌，自養性細菌在代謝過程中把氨氮、硫化氫等等異養性細菌代謝物轉化成對魚蝦無害的菌蛋白或者菌其他成分。

水體中的這兩類微生物對消毒藥的抵抗、耐受能力有明顯不同。在消毒劑剛剛使用后，上述二類菌都會部分被抑制，其中EM、光合細菌會被大量的殺滅?？莶輻U菌會大量形成芽孢狀產生自我保護。隨著時間的推移，藥物濃度逐漸降低，這時候異養性細菌開始大量繁殖，將池中的有機物迅速分解并釋出氨、硫化氫等有害物質。而自養性細菌的繁殖速度會比異養性細菌慢100倍以上，水體中微生態這時候的不平衡就導致了氨、硫化氫等有害物質的積累，導致消毒劑使用1～2天后，可能會出現氨、硫化氫等有害物質迅速升高的異?，F象，尤其在水溫比較高的冬棚或者小棚中比較容易出現這種情況。